In Silico Evaluation of Putative S100B Interacting Proteins in Healthy and IBD Gut Microbiota
In Silico Evaluation of Putative S100B Interacting Proteins in Healthy and IBD Gut Microbiota
Orsini M, Di Liddo R, Valeriani F, Mancin M, D’Incà R, Castagnetti A, Aceti A, Parnigotto PP, Romano Spica V, Michetti F.
Cells. 2020; 9(7): E1697.
La diafonia tra il microbiota intestinale umano e la parete intestinale è essenziale per l’omeostasi e la tolleranza immunitaria dell’organo.
Il microbiota intestinale svolge un ruolo in condizioni sane e patologiche mediate da processi infiammatori o dagli assi intestino-cervello, entrambi coinvolgendo un possibile ruolo per la proteina S100B come citochina diffusibile presente non solo nella mucosa intestinale ma anche nelle feci.
Al fine di identificare le proteine bersaglio per una presunta interazione tra S100B e il proteoma del microbiota, abbiamo sviluppato un flusso di lavoro bioinformatico integrando le caratteristiche di interazione di domini noti con i dati di proteomica derivati da studi metatassonomici del microbiota intestinale da malattie intestinali sane e infiammatorie (IBD ) soggetti.
Sulla base della composizione del microbiota, infatti, sono state riscontrate proteine che interagiscono presumibilmente con i domini S100B, sia in soggetti sani che in pazienti IBD, in numero ridotto in questi ultimi campioni, esibendo anche differenze nell’occorrenza di domini interagenti tra i due gruppi.
Inoltre, sono state osservate differenze tra colite ulcerosa e campioni di malattia di Crohn.
Questi risultati offrono il quadro concettuale per indagare il ruolo di S100B come molecola di segnalazione candidata nel meccanismo di comunicazione microbiota / intestino, sulla base di interazioni diversamente condizionate da microbiota sano o patologico.
